LRECA代码基本说明:本代码包含蛋白质相分离特性检测和溯源两部分内容
RCNN_model文件夹包含特性检测代码。
具体包含LLPS和PDB、phaspDB_reviewed和PDB、phasepDB_highthroughput和PDB、mydata_1507和PDB数据集训练的代码。
RCNN_ECA_saliency文件夹包含特性溯源代码。具体包含LCRs_process、saliency_functi、save_model文件夹。
LCRs_process文件夹包含了read_LCRs_segment.py用于和已有的LCRs片段比较分析,split_LCRs_segment.py用于根据氨基酸序列每个位置贡献值的概率密度生成片段并突出贡献值最大的氨基酸片段;
saliency_functio文件夹中method文件夹中包含了生成氨基酸序列每个位置贡献值的代码,statics文件夹包含了对氨基酸序列每个位置贡献值统计分析的代码,RCNN_ECA_save_model.py文件用于保存训练好的模型和参数;
save_model文件夹保存训练好的特性检测模型和参数。
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